铁矿石保税标准仓单能当保证金使用，保税标准仓单作为保证金的市值计算方法如下：

1.结算时市值计算：每日结算时，交易所以该标准仓单对应品种最近交割月份期货合约当日结算价扣除税费后的价格为基准价，计算其市值。具体计算公式为：结算时保税仓单作为保证金的基准价=[(该品种最近交割月份期货合约的当日结算价-相关费用)/(1+进口增值税税率)-消费税]/(1+进口关税税率)；

2.闭市前市值计算：当日闭市前，以该保税标准仓单对应品种最近交割月份期货合约的前一交易日结算价扣除税费后的价格为基准价，计算其市值。具体计算公式为：闭市前保税仓单作为保证金的基准价=[(该品种最近交割月份期货合约的前一交易日结算价-相关费用)/(1+进口增值税税率)-消费税]/(1+进口关税税率)。

注意，“相关费用”包括商品进口报关、报检及代理服务等费用。